Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms