Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FGF3P11487 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FGF3P11487 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms