Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMIGD3P0DMS9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIGD3P0DMS9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms