Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPARCP09486 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPARCP09486 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms