Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB1P08238 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms