Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT6BP04259 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms