Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms