Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NUDT3O95989 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms