Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC3O60481 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms