Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPLO60437 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPLO60437 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPLO60437 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms