Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KALRNO60229 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KALRNO60229 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KALRNO60229 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms