Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms