Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COCHO43405 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COCHO43405 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COCHO43405 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COCHO43405 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms