Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PCH4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PCH4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E9PCH4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PCH4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PCH4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms