Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L13C9JLJ4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms