Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GGTLC3B5MD39 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms