Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HMGB1P1B2RPK0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HMGB1P1B2RPK0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms