Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRRM4A7MD48 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms