Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms