Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
C9orf92A6NGG3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
C9orf92A6NGG3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms