Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms