Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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