Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms