Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYVE1Q9Y5Y7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms