Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD54L2Q9Y4B4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms