Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF330Q9Y3S2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms