Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms