Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHANK2Q9UPX8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHANK2Q9UPX8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms