Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms