Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5BQ9UGL1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms