Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFDP1Q9UEE9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms