Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms