Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms