Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TREX1Q9NSU2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms