Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PNPLA3Q9NST1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms