Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSU72Q9NP77 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms