Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms