Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMURF2Q9HAU4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms