Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP4Q9H6H4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms