Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MIXL1Q9H2W2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MIXL1Q9H2W2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms