Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms