Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms