Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms