Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR3CQ9BUI4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms