Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCMBPQ9BTE3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms