Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARAP1Q96P48 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms