Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PRAC1Q96KF2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms