Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms