Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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GTF3C6Q969F1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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