Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBXN4Q92575 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms